温州医科大学儿科学为浙江省一流学科和浙江省高校重中之重一级学科（温州医科大学临床医学）的重要组成部分，是全国高校儿科专业”十三五”国家级规划教材评审委员单位,国家卫生计生委住院医师培训基地（重点）和专科医师培训基地。儿科（呼吸）是原卫生部国家临床重点专科，儿科呼吸免疫、小儿外科学和围产医学是浙江省医学支撑学科，心脏发育及心血管疾病整合医学、儿童睡眠医学是浙江省医学创新学科，中西医结合儿科肾脏是浙江省中医药重点扶持学科，儿童中医科是浙江省中医药重点专科。学科为中华医学会小儿外科分会肿瘤学组副组长单位，浙江省医学会儿科分会侯任主委单位，浙江省医学会小儿外科学分会前任主任委员单位，浙江省医师协会小儿外科医师分会前任会长单位，浙江省医师协会新生儿科医师分会现任会长单位，同时也是浙江省医学会儿科免疫学组、感染学组组长单位，浙江省神经外科学分会小儿神经外科学组组长单位。